La loi sur la gestion de la crise sanitaire prévoit une obligation vaccinale des soignants et des professionnels de santé, dont les pharmaciens, contre la Covid-19.

En officine, sont concernés les titulaires, les préparateurs, les étudiants et les personnes travaillant dans les locaux, sauf les personnes effectuant une tâche ponctuelle. Cette obligation vaccinale est mise en place en plusieurs étapes :
- depuis le 9 août et jusqu’au 14 septembre 2021 inclus : les professionnels de santé dont le schéma vaccinal n’est pas complet ont la possibilité de présenter un certificat de rétablissement, un test de non contamination ou un certificat médical de contre-indication ;
- à compter du 15 septembre et jusqu’au 15 octobre 2021 inclus : les professionnels de santé seront autorisés à exercer leur activité à condition de justifier auprès de l’administration d’au moins une des doses requises dans le cadre du schéma vaccinal à plusieurs doses, et de présenter le résultat d’un test de non contamination ;
- à compter du 16 octobre 2021 : les professionnels de santé libéraux non vaccinés ou dont le schéma vaccinal n’est pas complet seront interdits d’exercer.
En outre, le pharmacien employeur est chargé de contrôler l’obligation vaccinale des salariés de l’officine (loi 2021-1040 du 5.8.2021, JO du 6).